Przeciwwskazania do wykonania badania wynikają z istoty metody diagnostycznej, jaką jest rezonans magnetyczny, wykorzystuje ona bowiem właściwości magnetyczne komórek ciała człowieka i wymaga umieszczenia pacjenta w silnym polu magnetycznym.
W tych przypadkach konieczne jest dostarczenie przed badaniem informacji od lekarza kierującego o braku przeciwwskazań do wykonania badania rezonansu magnetycznego.